Dr. Jörg Schaarschmidt
- Scientist
- Research Unit: Multiscale Materials Modelling and Virtual Design
- Room: 0-221
- Phone: +49 721 608-26715
- joerg schaarschmidt ∂does-not-exist.kit edu
Karlsruhe Institute of Technology (KIT)
Institute of Nanotechnology
Hermann-von-Helmholtz-Platz 1
76344 Eggenstein-Leopoldshafen, Germany
Publications
The HADDOCK2.4 web server for integrative modeling of biomolecular complexes
Honorato, R. V.; Trellet, M. E.; Jiménez-García, B.; Schaarschmidt, J. J.; Giulini, M.; Reys, V.; Koukos, P. I.; Rodrigues, J. P. G. L. M.; Karaca, E.; Zundert, G. C. P. van; Roel-Touris, J.; Noort, C. W. van; Jandová, Z.; Melquiond, A. S. J.; Bonvin, A. M. J. J.
2024. Nature Protocols, 19 (11), 3219–3241. doi:10.1038/s41596-024-01011-0
Honorato, R. V.; Trellet, M. E.; Jiménez-García, B.; Schaarschmidt, J. J.; Giulini, M.; Reys, V.; Koukos, P. I.; Rodrigues, J. P. G. L. M.; Karaca, E.; Zundert, G. C. P. van; Roel-Touris, J.; Noort, C. W. van; Jandová, Z.; Melquiond, A. S. J.; Bonvin, A. M. J. J.
2024. Nature Protocols, 19 (11), 3219–3241. doi:10.1038/s41596-024-01011-0
Shared metadata for data-centric materials science
Ghiringhelli, L. M.; Baldauf, C.; Bereau, T.; Brockhauser, S.; Carbogno, C.; Chamanara, J.; Cozzini, S.; Curtarolo, S.; Draxl, C.; Dwaraknath, S.; Fekete, Á.; Kermode, J.; Koch, C. T.; Kühbach, M.; Ladines, A. N.; Lambrix, P.; Himmer, M.-O.; Levchenko, S. V.; Oliveira, M.; Michalchuk, A.; Miller, R. E.; Onat, B.; Pavone, P.; Pizzi, G.; Regler, B.; Rignanese, G.-M.; Schaarschmidt, J.; Scheidgen, M.; Schneidewind, A.; Sheveleva, T.; Su, C.; Usvyat, D.; Valsson, O.; Wöll, C.; Scheffler, M.
2023. Scientific Data, 10 (1), Art.-Nr.: 626. doi:10.1038/s41597-023-02501-8
Ghiringhelli, L. M.; Baldauf, C.; Bereau, T.; Brockhauser, S.; Carbogno, C.; Chamanara, J.; Cozzini, S.; Curtarolo, S.; Draxl, C.; Dwaraknath, S.; Fekete, Á.; Kermode, J.; Koch, C. T.; Kühbach, M.; Ladines, A. N.; Lambrix, P.; Himmer, M.-O.; Levchenko, S. V.; Oliveira, M.; Michalchuk, A.; Miller, R. E.; Onat, B.; Pavone, P.; Pizzi, G.; Regler, B.; Rignanese, G.-M.; Schaarschmidt, J.; Scheidgen, M.; Schneidewind, A.; Sheveleva, T.; Su, C.; Usvyat, D.; Valsson, O.; Wöll, C.; Scheffler, M.
2023. Scientific Data, 10 (1), Art.-Nr.: 626. doi:10.1038/s41597-023-02501-8
SimStack: An Intuitive Workflow Framework
Rêgo, C. R. C.; Schaarschmidt, J.; Schlöder, T.; Penaloza-Amion, M.; Bag, S.; Neumann, T.; Strunk, T.; Wenzel, W.
2022. Frontiers in Materials, 9 (4), Art.-Nr.: 877597. doi:10.3389/fmats.2022.877597
Rêgo, C. R. C.; Schaarschmidt, J.; Schlöder, T.; Penaloza-Amion, M.; Bag, S.; Neumann, T.; Strunk, T.; Wenzel, W.
2022. Frontiers in Materials, 9 (4), Art.-Nr.: 877597. doi:10.3389/fmats.2022.877597
Workflow Engineering in Materials Design within the BATTERY 2030+ Project
Schaarschmidt, J.; Yuan, J.; Strunk, T.; Kondov, I.; Huber, S. P.; Pizzi, G.; Kahle, L.; Bölle, F. T.; Castelli, I. E.; Vegge, T.; Hanke, F.; Hickel, T.; Neugebauer, J.; Rêgo, C. R. C.; Wenzel, W.
2022. Advanced Energy Materials, 12 (17), Art.-Nr.: 2102638. doi:10.1002/aenm.202102638
Schaarschmidt, J.; Yuan, J.; Strunk, T.; Kondov, I.; Huber, S. P.; Pizzi, G.; Kahle, L.; Bölle, F. T.; Castelli, I. E.; Vegge, T.; Hanke, F.; Hickel, T.; Neugebauer, J.; Rêgo, C. R. C.; Wenzel, W.
2022. Advanced Energy Materials, 12 (17), Art.-Nr.: 2102638. doi:10.1002/aenm.202102638
An environment for sustainable research software in Germany and beyond: current state, open challenges, and call for action
Anzt, H.; Bach, F.; Druskat, S.; Löffler, F.; Loewe, A.; Renard, B. Y.; Seemann, G.; Struck, A.; Achhammer, E.; Aggarwal, P.; Appel, F.; Bader, M.; Brusch, L.; Busse, C.; Chourdakis, G.; Dabrowski, P. W.; Ebert, P.; Flemisch, B.; Friedl, S.; Fritzsch, B.; Funk, M. D.; Gast, V.; Goth, F.; Grad, J.-N.; Hegewald, J.; Hermann, S.; Hohmann, F.; Janosch, S.; Kutra, D.; Linxweiler, J.; Muth, T.; Peters-Kottig, W.; Rack, F.; Raters, F. H. C.; Rave, S.; Reina, G.; Reißig, M.; Ropinski, T.; Schaarschmidt, J.; Seibold, H.; Thiele, J. P.; Uekermann, B.; Unger, S.; Weeber, R.
2021. F1000Research, 9, 295. doi:10.12688/f1000research.23224.2
Anzt, H.; Bach, F.; Druskat, S.; Löffler, F.; Loewe, A.; Renard, B. Y.; Seemann, G.; Struck, A.; Achhammer, E.; Aggarwal, P.; Appel, F.; Bader, M.; Brusch, L.; Busse, C.; Chourdakis, G.; Dabrowski, P. W.; Ebert, P.; Flemisch, B.; Friedl, S.; Fritzsch, B.; Funk, M. D.; Gast, V.; Goth, F.; Grad, J.-N.; Hegewald, J.; Hermann, S.; Hohmann, F.; Janosch, S.; Kutra, D.; Linxweiler, J.; Muth, T.; Peters-Kottig, W.; Rack, F.; Raters, F. H. C.; Rave, S.; Reina, G.; Reißig, M.; Ropinski, T.; Schaarschmidt, J.; Seibold, H.; Thiele, J. P.; Uekermann, B.; Unger, S.; Weeber, R.
2021. F1000Research, 9, 295. doi:10.12688/f1000research.23224.2
An environment for sustainable research software in Germany and beyond: current state, open challenges, and call for action
Anzt, H.; Bach, F.; Druskat, S.; Löffler, F.; Loewe, A.; Renard, B. Y.; Seemann, G.; Struck, A.; Achhammer, E.; Aggarwal, P.; Appel, F.; Bader, M.; Brusch, L.; Busse, C.; Chourdakis, G.; Dabrowski, P. W.; Ebert, P.; Flemisch, B.; Friedl, S.; Fritzsch, B.; Funk, M. D.; Gast, V.; Goth, F.; Grad, J.-N.; Hermann, S.; Hohmann, F.; Janosch, S.; Kutra, D.; Linxweiler, J.; Muth, T.; Peters-Kottig, W.; Rack, F.; Raters, F. H. C.; Rave, S.; Reina, G.; Reißig, M.; Ropinski, T.; Schaarschmidt, J.; Seibold, H.; Thiele, J. P.; Uekermann, B.; Unger, S.; Weeber, R.
2020. F1000Research, 9, Article no: 295. doi:10.12688/f1000research.23224.1
Anzt, H.; Bach, F.; Druskat, S.; Löffler, F.; Loewe, A.; Renard, B. Y.; Seemann, G.; Struck, A.; Achhammer, E.; Aggarwal, P.; Appel, F.; Bader, M.; Brusch, L.; Busse, C.; Chourdakis, G.; Dabrowski, P. W.; Ebert, P.; Flemisch, B.; Friedl, S.; Fritzsch, B.; Funk, M. D.; Gast, V.; Goth, F.; Grad, J.-N.; Hermann, S.; Hohmann, F.; Janosch, S.; Kutra, D.; Linxweiler, J.; Muth, T.; Peters-Kottig, W.; Rack, F.; Raters, F. H. C.; Rave, S.; Reina, G.; Reißig, M.; Ropinski, T.; Schaarschmidt, J.; Seibold, H.; Thiele, J. P.; Uekermann, B.; Unger, S.; Weeber, R.
2020. F1000Research, 9, Article no: 295. doi:10.12688/f1000research.23224.1
An overview of data‐driven HADDOCK strategies in CAPRI rounds 38-45
Koukos, P. I.; Roel-Touris, J.; Ambrosetti, F.; Geng, C.; Schaarschmidt, J.; Trellet, M. E.; Melquiond, A. S. J.; Xue, L. C.; Honorato, R. V.; Moreira, I.; Kurkcuoglu, Z.; Vangone, A.; Bonvin, A. M. J. J.
2020. Proteins, 88 (8), 1029–1036. doi:10.1002/prot.25869
Koukos, P. I.; Roel-Touris, J.; Ambrosetti, F.; Geng, C.; Schaarschmidt, J.; Trellet, M. E.; Melquiond, A. S. J.; Xue, L. C.; Honorato, R. V.; Moreira, I.; Kurkcuoglu, Z.; Vangone, A.; Bonvin, A. M. J. J.
2020. Proteins, 88 (8), 1029–1036. doi:10.1002/prot.25869